水师虽然归张可大统领，但是张可大并不重视水师，而且也基本用不上他们，所以对他们也就没怎么管理。
听到张可大的命令后，他们如释重负，还担心张可大要他们一起与水城共存亡呢，既然让他们率领舰队离开，他们又有什么不满呢？
交代完这些事情后，张可大回到自己的府中，张可大跪辞母亲，吩咐弟弟张可度、儿子张鹿征代他送母亲乘船去天津，以保障母亲的安全。
此时的张可大心神俱疲，他拖着伤痕累累疲惫已极的身子，独自踉踉跄跄向位于太平楼的总镇府衙走去。
冬日的寒气格外逼人，张可大瞧着空中飞舞旋转的枯叶衰草，似乎在它们身上找到了自己永恒的归宿。
来到总镇府，他踱到值房的外间，这里的一瓶一花一案一几，无不相稔，房间左首放置着高高的书柜，堆放着满满书囊，案几上笔砚罗列，有几本碑帖还在零乱翻放着。
此时此刻，他头脑异常清晰：孙元化主抚，他主剿。孙元化的的抚策彻底失败，他这个山东总兵也是无路可退！思着自己一生南下征黎，挥师灭倭，北上勤王，剿灭白莲教，屡立战功，今受制于孙元化这个颟顸糊涂的巡抚一个“抚”字，施志不得，功将垂败，遗恨终生啊！
他从笔架上拔下了一管最大号万年枝竹管大提笔，蘸足墨汁，在东山墙壁上飞笔纵横：
辽事未靖贼围登，
巡抚昏愦堕帮凶。
空谈招抚酿国难，
以身酬志铸剑魂！
...
写毕，他最后望了一眼厅堂正中悬挂着的楹联：君恩深似海，臣节重如山。
思着想着，他眼下能做的就是不逃不降，以死来报效皇上朝廷！
张可大踱到大门前，面朝西北的皇城方向下跪磕头，之后，他毅然悬梁自尽！
水城的夜空下，炮声隆隆，烈焰腾空……
此次事变之后，朝廷赠张可大从一品荣禄大夫、太子少傅，谥“庄节”，赐祭葬，予世荫。建祠曰“旌忠”。
张可大在出任舟山副总兵时，曾主持修建抵御倭寇的城墙。舟山城内外有数千亩良田，因为海潮害稼，他积极主张筑碶蓄淡水。几年之后，这里变为膏腴之地。舟山百姓美其名曰“张公碶”。