这种做法虽然对于控制军队、防止割据具有一定的作用，但也降低和削弱了军队的战斗力。
尤其是监察官员制肘太多，使带兵的武将无所作用。
为了提高军队的战斗力，必须赋予军事将领“专断”的权力。
于是张居正奏请明穆宗赋予边将更多主动权，大大提高了战守能力。
张居正在加强战守力量的同时，又积极寻求改善蒙汉关系。
张居正的“外示羁糜”，是在“内修守备”的前提下，力争改善汉蒙关系，并积极加强友好往来。
万历初年，张居正为首辅，更加强了“内修守备”的工作。
一方面，他以“积钱谷、修险隘、练兵马、整器械、开屯田、理盐法、收塞马、散叛党”八事督课边臣，务必使边防军事落之实处，行之有效。
另一方面，知人善任，大胆任用堪当一面的将领全权处理边防事务。
戚继光的戚家军能大放异彩，张居正功不可没。
没有张居正支持，戚继光很难做到这种程度。
戚家军训练武器这些都需要大量资源。
推行一条鞭法，整顿赋役制度、扭转财政危机，是张居正改革的重点。
明中叶，由于土地兼并、隐漏，人口逃亡流失，户田二籍混乱失真。
豪民有田无粮，穷民摊派受病。
朝廷控制的田亩、人丁日益短缩，财源祜竭，所谓:私家日富，公室日贫，国匮民穷，病实在此。
针对这种弊端，张居正对天下田亩通行丈量，总计田数700万顷，比明初还少100余万顷。
主要目的是复旧额。
较弘治时期多出300万顷。
其中，虽有部分因官吏改用小弓丈量以增加田额的虚报浮夸之处。
但也确实清查出相当一部分豪强地主隐瞒的土地，清丈使“小民实被实惠，而于官豪之家殊为未便”。
所以遭到反对。
但有利于改变赋役不均状况，使得粮不增加而轻重适均，将来国赋既易采纳，而小民如获更生。